Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT9P35527 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT9P35527 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT9P35527 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms