Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-2B6SEH9 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms