Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3CA6NKF2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID3CA6NKF2 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376.7 ms