Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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