Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms