Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COL4A6Q14031 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COL4A6Q14031 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COL4A6Q14031 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COL4A6Q14031 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COL4A6Q14031 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COL4A6Q14031 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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