Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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