Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms