Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMF1P82094 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMF1P82094 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms