Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms