Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2A2P16615 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms