Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXD8P13378 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms