Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms