Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms