Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms