Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms