Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC102BQ68D86 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC102BQ68D86 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms