Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
KRTAP13-4Q3LI77 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms