Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms