Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SFTPCP11686 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms