Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms