Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
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BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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