Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGF29Q96ES7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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