Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C18orf8Q96DM3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms