Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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