Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1SQ13698 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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