Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFTRP13569 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFTRP13569 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFTRP13569 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFTRP13569 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms