Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TMEM225BP0DP42 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms