Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC112Q8NEF3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms