Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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