Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EDRF1Q3B7T1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms