Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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