Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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AP3B2Q13367 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3B2Q13367 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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