Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HBA1P69905 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HBA1P69905 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms