Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CTSSP25774 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms