Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRM1P11229 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.8 ms