Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms