Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SGF29Q96ES7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGF29Q96ES7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SGF29Q96ES7 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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