Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms