Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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