Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC186Q7Z3E2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms