Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM208BQ5VWN6 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms