Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP7AQ04656 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms