Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NESP48681 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NESP48681 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms