Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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HOXD10P28358 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXD10P28358 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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