Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BRAFP15056 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BRAFP15056 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms