Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LINC01304-203ENST00000453880 812 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP002761.2-201ENST00000541254 618 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC093390.2-202ENST00000638236 976 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RPL35P3-201ENST00000403133 371 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 VPS29-203ENST00000546588 1059 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms