Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SCN2BO60939 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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