Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TARSL2A2RTX5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms