Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CEP44Q9C0F1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms